Composta por um secretário executivo e um ou mais adjuntos, indicados pelo Conselho Diretor e referendados pela Assembléia Geral, é o órgão e administração do instituto.

O secretário executivo e os adjuntos dividirão entre si as tarefas da Secretaria Executiva e responderão pelo órgão além de coordenar suas atividades. Entre elas, destacam-se: supervisionar e executar as funções administrativas, financeiras, orçamentárias e de planejamento; elaborar e revisar os relatórios técnicos e financeiros dos projetos e atividades do Instituto antes de sua apreciação pelo Conselho Diretor; planejar e analisar as atividades e orçamentos semestrais e submetê-los a apreciação do Conselho Diretor; coordenar as atividades de captação de recursos da entidade; contratar pessoas físicas ou jurídicas necessárias às atividades administrativas e técnicas do Instituto; contratar, demitir, transferir e enquadrar na política geral de cargos e salários, pessoal técnico e funcional e outras providências relacionadas ao corpo funcional, necessárias ao cumprimento dos Planos de Trabalho aprovados pela Assembléia Geral; aceitar doações e subvenções, desde que as mesmas não comprometam a autonomia e independência do Instituto; indicar os representantes do Instituto junto a seminários, simpósios, congressos e demais eventos nacionais e internacionais; encaminhar ao Conselho Diretor as demonstrações contábeis-financeiras do Instituto e a previsão orçamentária anual.

Secretário Executivo
Sergio Mauro Santos Filho (Sema)

Secretário Executivo Adjunto
Enrique Svirsky