Os Kuikuro fazem parte do que pode ser chamado de subsistema carib alto-xinguano. Este é constituído, hoje, por quatro grupos: além dos Kuikuro, os Matipu, os Nahukwá e os Kalapalo. Seu território tradicional é a região oriental da bacia hidrográfica dos formadores do rio Xingu (rios Culuene, Buriti e Curisevo). Os Kuikuro habitam, hoje, três aldeias. A aldeia principal e maior é Ipatse, pouco distante da margem esquerda do médio Culuene, onde vivem mais de 300 pessoas. Em 1997 surgiu a aldeia de Ahukugi, na margem direita do Culuene, rio acima de Ipatse, hoje com cerca de 100 pessoas. Mais recentemente, formou-se uma terceira aldeia no local da antiga Lahatuá, com um grupo familiar de uma dezena de pessoas. Uns 30 Kuikuro vivem na aldeia Yawalapiti. Fortes e intensas alianças políticas e matrimoniais entre Kuikuro e Yawalapiti ajudaram o ressurgimento dos Yawalapiti como aldeia (e como grupo local) a partir dos anos 50. Em conseqüência de inter-casamentos, outros Kuikuro vivem em outras aldeias do Alto Xingu, sobretudo nas dos outros povos carib da região.